Bioinformática Livre

Repositório do GitHub com datasets para análise de dados biológicos

GitHub - OpenGene/awesome-bio-datasets: awesome-bio-datasets awesome-bio-datasets. Contribute to OpenGene/awesome-bio-datasets development by creating an account on GitHub.

Biopython: manipulando dados biológicos usando Python e Colab.
https://bioinfo.com.br/biopython-uma-breve-introducao-a-manipulacao-de-dados-biologicos-em-python-usando-colab/

Tutorial de Aprendizado profundo na Biologia computacional: do DNA ao dobramento de proteínas e dobra alfa2

Artigo:

Deep learning on computational biology and bioinformatics tutorial: from DNA to protein folding and alphafold2 | AI Summer A self-complete guide for understanding biology concepts that are necessary for applying deep learning in biology and bioinformatics focused on protein folding and alphafold2 related stuff

How to have ideas for a scientific project? The importance of inspiration and perspiration in scientific research.

Cientistas finalmente descobriram como o vírus SARS-CoV-2 sequestra e causa danos às células pulmonares humanas.

Os pesquisadores identificaram proteínas do hospedeiro e vias em células pulmonares cujos níveis mudam após a infecção pelo SARS-CoV-2, fornecendo informações sobre a patologia da doença e novos alvos terapêuticos para bloquear COVID-19.

Fonte: https://www.sciencedaily.com/releases/2020/12/201202114502.htm?fbclid=IwAR03xmky5v8b_P9myhyHCDs0ENY6bjF-xQ45abQ3zivjF1Eiw4FcsyXmPdU

Como utilizar inteligência artificial para fazer buscas de pessoas perdidas por meio de drones

Using artificial intelligence to help drones find people lost in the woods A trio of researchers at Johannes Kepler University has used artificial intelligence to improve thermal imaging camera searches of people lost in the woods. In their paper published in the journal Nature Machine Intelligence, David Schedl, Indrajit Kurmi and Oliver Bimber, describe how they applied....

"Os sistemas biológicos funcionam por meio de processos celulares intrinsecamente orquestrados, nos quais várias entidades celulares - RNAs, metabólitos e proteínas participam de uma maneira rigidamente regulada. As proteínas estão no "núcleo executivo" desses eventos celulares, e seus comportamentos alterados têm sido implicados em uma miríade de doenças patológicas, o que também as torna de longe a principal classe de alvos de dr**as. Portanto, compreender a estrutura, a dinâmica e as interações das proteínas tem estado no cerne da pesquisa biomédica desde o seu início. Devido às limitações dos métodos bioquímicos e tecnologias associadas, esses estudos têm sido tradicionalmente realizados em proteínas únicas, ao invés de toda a população de proteínas expressas em uma célula ou tecido, o 'proteoma'. A disciplina de proteômica foi inicialmente equiparada à eletroforese em gel bidimensional, uma tecnologia de baixa resolução que só pode analisar as proteínas mais abundantes em uma amostra. Nos últimos anos, a espectrometria de massa (MS) tornou-se uma tecnologia poderosa para estudar proteínas em grande escala. Combinado com estratégias experimentais inovadoras e avanços em métodos computacionais, a proteômica baseada em MS agora permite o estudo global de proteomas celulares."

Alguns softwares de Bioinformática:

NetSurfP - Previsões de Acessibilidade de Superfície de Proteína e Estrutura Secundária
NetTurnP - Predição de regiões beta-turn em sequências de proteínas
MODELADOR - Usado para homologia ou modelagem comparativa de estruturas tridimensionais de proteínas
AutoDock - Conjunto de ferramentas de encaixe automatizadas
Gromacs - Um pacote de dinâmica molecular projetado principalmente para sistemas biomoleculares, como proteínas e lipídios
OrfPredictor - O servidor OrfPredictor (ORF-Predictor) é projetado para predição de ORF e tradução de um lote de sequências de EST ou cDNA